新技術(shù)可快速測出兒童白血病的基因組異常
更新時間：2024/9/23 10:33:19 來源：新華社
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日本東京大學和國立癌癥研究中心日前聯(lián)合發(fā)布新聞公報說，兩家機構(gòu)的研究人員利用一種新的基因組分析法，快速且全面地檢測出兒童白血病的基因組異常。
基因組分析對于癌癥的精準診斷、確定治療靶點非常重要。日本研究人員利用納米孔測序儀的自適應(yīng)采樣技術(shù)進行測序，然后處理和分析所獲數(shù)據(jù)。納米孔測序儀能進行長讀長測序，即讀取更長的脫氧核糖核酸（DNA）片段，與常規(guī)測序技術(shù)相比，在解析復(fù)雜的基因組結(jié)構(gòu)方面具有獨特的優(yōu)勢。自適應(yīng)采樣則是一種實時動態(tài)調(diào)整采樣率的方法，使得采集的樣本更具有代表性。
研究人員分析了28個兒童白血病病例的基因組數(shù)據(jù)，以驗證其有效性。結(jié)果顯示，28個病例中有24例檢測出了重要基因組變異，其中12個病例是以往方法難以檢測出的基因組結(jié)構(gòu)異常。此外，以往測序技術(shù)耗時長，從提交樣本到結(jié)果返回需要超過一個月時間，而新的基因組分析法72小時就能獲得結(jié)果。
公報說，本項研究構(gòu)建的分析方法應(yīng)用范圍廣泛，還能用于藥物代謝相關(guān)的基因詳細分析，還可檢測出可成為治療效果指標的基因組變化。不過，與現(xiàn)有測序技術(shù)相比，自適應(yīng)采樣在檢測單核苷酸變異、小片段基因的插入和缺失方面并不具備優(yōu)勢。研究人員計劃通過完善分析軟件等方法提高成功率。
本項研究相關(guān)成果已發(fā)表于新一期《血癌雜志》上。
（記者錢錚）
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日本東京大學和國立癌癥研究中心日前聯(lián)合發(fā)布新聞公報說，兩家機構(gòu)的研究人員利用一種新的基因組分析法，快速且全面地檢測出兒童白血病的基因組異常。
基因組分析對于癌癥的精準診斷、確定治療靶點非常重要。日本研究人員利用納米孔測序儀的自適應(yīng)采樣技術(shù)進行測序，然后處理和分析所獲數(shù)據(jù)。納米孔測序儀能進行長讀長測序，即讀取更長的脫氧核糖核酸（DNA）片段，與常規(guī)測序技術(shù)相比，在解析復(fù)雜的基因組結(jié)構(gòu)方面具有獨特的優(yōu)勢。自適應(yīng)采樣則是一種實時動態(tài)調(diào)整采樣率的方法，使得采集的樣本更具有代表性。
研究人員分析了28個兒童白血病病例的基因組數(shù)據(jù)，以驗證其有效性。結(jié)果顯示，28個病例中有24例檢測出了重要基因組變異，其中12個病例是以往方法難以檢測出的基因組結(jié)構(gòu)異常。此外，以往測序技術(shù)耗時長，從提交樣本到結(jié)果返回需要超過一個月時間，而新的基因組分析法72小時就能獲得結(jié)果。
公報說，本項研究構(gòu)建的分析方法應(yīng)用范圍廣泛，還能用于藥物代謝相關(guān)的基因詳細分析，還可檢測出可成為治療效果指標的基因組變化。不過，與現(xiàn)有測序技術(shù)相比，自適應(yīng)采樣在檢測單核苷酸變異、小片段基因的插入和缺失方面并不具備優(yōu)勢。研究人員計劃通過完善分析軟件等方法提高成功率。
本項研究相關(guān)成果已發(fā)表于新一期《血癌雜志》上。
（記者錢錚）
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